Проблемы с кишечником

Здравствуйте, Сергей! У нас такая проблема: у сына с рождения был жидкий стул, но помимо стула из попы постоянно бежало. Выписали нас из род. дома со страшной молочницей. Пропили Линекс, Бактисубтил, Хилак форте, Интестибактериофаг,Энтерофурил, Креон. Сдали анализ на усл.-потоген. флору, обнаружили Энеробактер 10в 8 степени, протеус мирабилис 10 в 6 ст., стафилокок 10 в 4. В моем молоке нашли только энтеробактер. После этого пропили Гентамицин. Но ничего не помогало. В 2 месяца я перестала давать все препараты и пропоила его кровохлебкой и козьим молоком. Стало легче, но каждый месяц по несколько дней опять начинает бежать. Сейчас ему 9 месяцев. Наш кишечник реагирует на все: на новые продукты, на прививки, на болезни. Врачи сначала настаивали на том, что это от моего молока и предлагали перейти на ИВ, а теперь, просто чтоб отстала, говорят что это функциональное. Что это может быть? Что с этим делать? не является ли это противопоказанием к прививкам? Спасибо.